山东省中医药文化博物馆，于2012年3月正式立项，2017年5月18日正式建成开馆，面向社会开放。2017年6月16日经山东省卫计委、省中医药管理局批准，更名为“山东省中医药文化博物馆”。

博物馆建设有展馆大厅、中医药史馆、中医药专题馆、中药标本馆、校史纪念馆等，总建筑面积5500余平方米。博物馆馆藏文物3000余件，古籍600余套，字画100余幅，中药标本10000余种，展陈实物与图文结合，穿插展示原始人类生活场景、中药炮制场景、动物姿态标本场景、中医坐堂场景等，设互动体验区，教育性与趣味性结合，科学性与观赏性结合，思想性与艺术性结合，集教学、科研、观赏、科普教育为一体，是普及医药知识、弘扬医学文化、培养医学人才和进行学术交流的重要窗口。

博物馆为全国中医药文化宣传教育基地、全国科普教育基地、山东省中医药文化宣传教育基地、山东省首批中医药健康旅游示范基地、山东省健康教育基地、山东省华侨国际文化交流基地、山东省中小学研学基地、山东省中小学生研学实践教育活动行走齐鲁资源单位、烟台市“治未病”廉政教育基地、烟台市爱国主义教育基地、烟台市社会科学普及教育基地、烟台市中小学综合实践教育基地、烟台市首批中小学生研学旅行基地等。2018年博物馆入选山东省高校思想政治工作十大建设计划部分重点项目，同年荣获“山东省创新型班组”“山东省工人先锋号”等荣誉称号。2019年，博物馆《讲好中医故事，打造杏林宣教品牌》项目荣获教育部第五届全国高校“礼敬中华优秀传统文化”特色展示项目。